种子是种地玩法种必不可少的基础，在后期最大的蔬菜来源也基本是通过种地玩法得到的，通过赶走随机落地的鸟或者与鱼王交易，都能得到种子，直接食用只能恢复极少的饱食度。将种子种到已开耕过的田地里，是会随机长出一种作物，其萌发的时间是和作物应季有关，生成的作物种类概率则是根据当前季节的不同所一项，例如在秋季种下种子，较大概率是会长出勿忘我这种杂草，冬季则是能大概率长出胡萝卜或者土豆。
想要种出制定的作物，就需要对应的作物种子，在收获对应农作物、给鸟笼的鸟喂食作物、摧毁巨大作物以及击败过果蝇王都能获得对应的作物种子。给浣猫“猫猫玩具”或者一些食物，也是有概率得到作物种子。不过在玩家使用耕作先驱帽对作物进行多次研究之前，这些作物种子的名称显示，只是根据其外观进行形容，像是胡萝卜种子在研究之前名称是椭圆形种子。
除了普通种子之外，作物种子都具有不可点燃性，所以在储备上玩家不用担心作物种子在夏天会自燃。种子的培养是非常重要的，不同的作物所需要的水分以及肥料都是不同的，这些都能在图鉴中更好的了解，在种子得到充分的培养保证其压力足够低，就能在收获时得到更多的种子，满足巨大作物的生长条件，还可以产出巨大作物。
