无尽的拉格朗日中拥有模块系统的舰艇主要集中在超主力舰、部分战巡与巡洋舰，包括太阳鲸、CV3000、南十字元帅、新君士坦丁大帝、乌拉诺斯之矛、永恒风暴、ST59级、普鲁图斯之盾等，少数工程与登陆舰也有专属作业模块，模块可大幅强化输出、防御、载机或工程能力，是舰队强度的核心分水岭。
超主力舰是模块体系的核心，太阳鲸作为经典航母，拥有M2大型载机、B2机库维护、C1防空等关键模块，M2可搭载8架中型战机，B2每次返航恢复10%载机血量，显著提升持续空战能力。CV3000航母模块偏向快速部署与泛用，南十字元帅则强化重型载机与远程打击，适配高端空优舰队。新君士坦丁大帝战巡主打火力，M2主炮强化、C3重型投射模块可叠加高额伤害，是舰队核心输出点。乌拉诺斯之矛侧重突击与破甲，永恒风暴M1过载输出模块每60秒触发一次3倍伤害与35%命中加成，适合爆发收割。
战巡与巡洋舰的模块性价比极高，ST59级战巡B2舰载机系统可携带4架中型战机，是孢子、砂龙的优质母舰，弥补小型舰队载机不足的短板。普鲁图斯之盾作为防御特化舰，A2/A3分别克制舰载机与投射武器，B2附加装甲模块大幅提升生存能力，C2防空拦截模块可高效拦截导弹与战机，是舰队的“移动屏障”。部分巡洋舰如枪骑兵级虽模块较少，但武器强化模块可提升导弹伤害与索敌速度，适配中速游击舰队。
工程与登陆舰模块偏向功能辅助，X8小型工程舰、云海级轻型登陆舰、诺玛M470级重型登陆舰可加装作业系统模块，提升资源采集、基地建造与登陆作战效率，在前期开荒与后期阵地战中不可或缺。模块解锁与装配需消耗技术点，非默认插槽解锁需10技术点，强化节点需按树状结构依次解锁，优先点核心输出或防御模块可快速形成战力。
模块搭配需结合舰队定位，空优舰队优先太阳鲸、南十字元帅的载机与维护模块，火力舰队选大帝、永恒风暴的主炮与投射模块，防御舰队用普鲁图斯之盾的装甲与防空模块，功能舰队则搭配工程舰作业模块。模块调校需同步强化，如太阳鲸载机模块点锁定、冷却、伤害，大帝主炮模块堆命中与破甲，最大化模块收益。实战中需根据敌方阵容灵活调整，对抗航母舰队强化防空模块，对抗重甲舰队选择破甲模块，让模块成为克制对手的关键。
