骷髅商人是一个非常特殊的NPC，和旅商类似，他是个不会入住的NPC。偶尔出现在洞穴层，和稀有小怪一样会被生命分析仪探测到。一旦他出现，刷怪量就会极大减少。因为他的存在相当于七个NPC，所以会极大减少怪物的出现。他是个比较特别的商人，在他的商店中可以买到和商人差不多的东西，例如绳子和炸弹。不过他还会卖更多特别的东西，在不同的月相期间，他会卖不同的东西，可以通过六分仪来知道每天的月相。
首先是一系列的物品，这些都是可以在地表木箱获得的。回旋臂、伞、火花魔棒、金属扣带、攀爬抓、雷达，还有植物纤维宝典以及没啥用的梯凳。这些东西的每一件，会在不同的月相售卖。在满月、下弦月、新月和上弦月，他会卖一些特殊的东西。第一个是诡药，这个药水是很特别的恢复药。它的恢复效果不稳定，会在七十到一百二之间取一个数字，恢复对应的血量，耐药性的效果时长也会在四十到七十秒之间随机。除了这些，它还有可能给玩家短暂的无敌时间。如果运气好，效果长达四秒。这个东西的效果太特殊了，不过基本上就是个不稳定的治疗药，无敌时间也基本用不到。
骨箭有着更高的伤害，并且可以穿透一个敌人。这个箭只能在他这里买到，在肉后他会卖渐变球，一个可以用来过渡的悠悠球。如果不是以上四种月相，他卖的东西会是回血药，普通的木剑和好胜球，其中好胜球比渐变球差一些。在夜晚或者满月的那一天，他会卖洞穴探险荧光棒。这个荧光棒的特点是除了光照效果，还可以让附近的宝物发光，类似洞穴探险药的效果。
如果有信号枪，他还会卖洞穴探险信号弹。如果不是以上的时间，他只会卖普通的荧光棒。在游戏中每分钟的前半段，他会卖骨头火把。除了特别的光照效果，还可以给没有环境火把的地方增加一点运气。如果是在每分钟的后半段，他只会卖普通的荧光棒。在满月的夜晚期间，他会卖魔法灯笼，这个是很特别的照明宠物。除了发光，它还有宝物探测的效果。他还会卖四种颜色的平衡锤，这些不同颜色的平衡锤售卖时间取决于不同的月相。
