辐射避难所减少人口核心是优先直接驱逐低价值居民，辅以废土流放、灾难剔除与生育管控，四管齐下高效控人口，同时规避资源浪费与负面状态。
直接驱逐是最安全高效的核心方法，无任何负面效果。先筛选目标居民，优先选择属性全低、无培养价值、等级低且无装备的居民，这类居民对避难所贡献极低，还持续消耗食物、水与电力。操作时，选中目标居民拖动到避难所大门外的废土区域，进入探索准备界面后，点击界面右下角红色驱逐图标，确认后即可永久移除该居民，人口数直接减少。该方式适用于所有多余人口，尤其适合快速清理大量低质居民，避免资源无谓消耗。
废土流放是无驱逐功能时的备选方案，适合处理低属性居民。将目标居民装备清空，不带武器、治疗针与抗辐宁，直接派往废土探索。低属性居民在废土极易遭遇死亡爪、蟑螂群等危险，无装备防护下很难存活，死亡后不会自动复活，一段时间后会从居民列表中消失，间接减少人口。需注意，流放居民死亡会轻微降低避难所幸福度，建议少量分批进行，同时安排高属性居民留守维持生产效率。
利用避难所灾难剔除多余人口，适合处理集中待清理的居民。选择无人或低优先级房间，反复点击“加速生产”触发灾难，如辐射蟑螂、火灾、鼹鼠入侵等。将无装备的目标居民拖入灾难房间，撤离其他有价值居民，让灾难自然击杀目标。居民死亡后可选择不复活，等待其消失即可减少人口。此方法效率高，但会降低幸福度且可能损坏房间，需控制使用频率，优先选择废弃或低级房间操作。
严格管控生育是从源头遏制人口增长的关键，避免人口持续膨胀。首先控制宿舍数量，不建造多余宿舍，现有宿舍不升级，保持人口上限与当前人口匹配，避免孕妇持续生产。其次阻止居民繁育，将男女居民分开安排工作，避免其在宿舍接触；发现孕妇后，不提供额外资源加速生产，甚至可将孕妇调离宿舍区域，延缓生产进度。拒绝外来流浪居民入住，关闭避难所大门，避免新居民加入导致人口进一步增加。
