对于刚突破40级的玩家，水毒牙阵容是性价比最高的选择。核心由水主、牙忍界大战、畜生道、小南组成。水主天赋需优先选择查克拉手术刀和水分身，搭配奥义治疗与普攻毒伤。该阵容通过牙的追打触发连击链，配合畜生道召唤物吸收伤害，小南的高闪避与水主治疗形成稳定续航。战斗中需注意优先击杀敌方高爆发单位，利用毒伤叠加消耗对手。
当玩家获取更多强力忍者后，可转向双奶队或水影护卫队进阶阵容。双奶队以水主、水手樱、四尾为核心，搭配水影或长十郎。四尾的结界破坏与点燃效果能有效压制敌方治疗，而双治疗角色保障队伍生存，适合对抗持久战。水影护卫队则依赖青、长十郎和照美冥的护盾机制，青的被动为水属性忍者提供护盾，长十郎的高爆发可在第二回合打出致命伤害。此阵容对先攻要求较高，需优先强化长十郎的速度属性。
资源有限的平民玩家可尝试控制型阵容，如井野少年篇、鹿丸、水主与忍刀再不斩的组合。井野与鹿丸的双控场能打断敌方关键奥义，再不斩的分身与水主治疗形成防线。该阵容操作核心在于第一回合井野控制敌方主输出，后续通过鹿丸定身与水主毒伤逐步瓦解对手。若拥有勘九郎，可替换为傀儡护盾流，进一步强化生存。
阵容搭配需注意三点：其一，水主天赋需根据队伍需求灵活调整，对抗高爆发阵容时可选择医疗心得提升治疗量，而持久战优先毒伤强化；其二，通灵兽选择影响连击链，蛤蟆忠可增强水主治疗，而忍犬适合追打型阵容；其三，40级后需注重忍者突破与装备精炼，尤其是牙、小南等核心角色的暴击与速度属性。通过合理搭配，水主能在副本、忍考与竞技场中展现多面价值。
