魔法方舟也叫遗忘方舟，是一个隐藏在地图深处的神秘区域，想要去那里探险，首先得知道怎么进去。从遇境进入墓土后，别急着往前冲，直接往右边飞，很快就能看到两棵高高的石柱，中间有水，那里停着一艘带白色光圈的小船。靠近点击坐下，耐心等待动画结束，就能直接传送到方舟了。
到了方舟后，会发现这里需要你的帮助才能恢复生机。和方舟中央的向导先祖对话，它会给你一系列任务，就是收集六种不同颜色的光芒，分别是念之灵、水之灵、风之灵、地之灵、心之灵和火之灵。每当你完成一个光芒的收集，记得回去找向导先祖提交，这样方舟就会一点点亮起来，而且每次提交还能拿到一颗爱心作为奖励。这些任务得一个一个来，不能跳着做。
这六种光芒散落在游戏的不同角落，找起来需要一点耐心。念之灵闪着红光，就在方舟后方的田地里或者附近的沉船地图里，很容易碰到。水之灵的蓝光藏身在霞谷的溜冰场，它一会儿在冰面上溜达，一会儿又钻到冰窟窿里，所以得多等等。风之灵的青光需要从云野的入口转身往后飞，钻进厚厚的云层里，仔细找就能发现。地之灵的绿光在云野右边的隐藏图里，那里全是浮空的岛屿，绿光会由天上的大鲲背着慢慢落下来，所以不用飞太高，在低处等着就行。心之灵的紫光躲在禁阁一楼的双人门里面，进去后飞到中间的大平台上就能看到。火之灵的橙光则在雨林的栈桥图左边的小树林中，雨林的雨水会消耗能量，所以去之前最好把能量补满。
当你把所有六种光芒都收集齐并提交给向导先祖后，遗忘方舟会彻底变样，从一片荒芜长出绿油油的植物，破损的船也装饰一新，整个区域都活了过来。这里会解锁一个魔法罐子，每天都能免费领取随机的魔法道具，非常实用。在方舟后侧的山坡上，还能找到复刻先祖，兑换一些独特的装扮，比如流苏斗篷、紫色头巾等。方舟的魔法工坊功能需要先完成魔法季的全部季节任务才能解锁。解锁后可以在这里获取各种魔法，比如漂浮魔法或其他实用道具，这能让你的旅行更方便。
