赤壁之战剧本的水战玩法是整个战役的核心部分，需要玩家从多个层面进行周密筹划。水上战斗贯穿地图队伍在水路相遇就会立即交战，无需连接土地即可攻打渡口等建筑，使得水陆作战相互联动。玩家必须首先解锁船坞，才能建造高级舰船如蒙冲、斗舰和楼船，这些船只拥有基础、中级和高级三种特性，必须通过升级船坞来解锁更高级的功能。
战前准备环节直接决定了赤壁之战的胜负走向。资源储备是基础，需要提前囤积足够的粮食、木材、石料和铁矿，确保在持久战中补给充足。道具准备方面，关键物品如秘法书在触发特殊剧情中不可或缺，需通过前期任务获取。武将等级提升至关重要，高等级谋略属性增强技能效果和策略命中率，建议将主力武将提升至35级以上以占据优势。装备选择上优先配备高攻击力武器如青铜剑和防御装备，以提升整体战斗力。
解锁后可以获得基础舰船走舸，高级舰船则需消耗同盟资源建造。船只一旦在战斗中被摧毁就需要重新建造，因此要妥善保护。水军兵种适性会影响武将的额外属性增益，通过提升船坞等级可以提高武将的水军适性，例如船坞达到3级时所有上阵武将水军适性会提升至A级。
技能配置需要根据武将特性灵活调整，主力输出武将适合配备水龙计、半月斩等范围攻击技能，军师类武将则可学习白马阵等提升团队速度的阵法。补给物品如赤心计、金仙丹等恢复类药水和解咒丹等解除负面状态的道具必不可少，建议每种至少准备10个以上以应对突发状况。优先抢占高地控制权，利用箭塔和城寨建立防御阵线。时机选择很关键，在敌方活跃度较低的深夜或凌晨发动攻击可以减少干扰。士气管理不容忽视，利用营帐减少士气消耗避免战力下降。因为其防御薄弱易被偷袭，要确保清除周围敌对势力。
